凝胶迁移或电泳迁移率检测是一种用于检测 DNA 结合蛋白的简单而快速的方法。这种方法被广泛用于序列特异 DNA 结合蛋白的研究，如转录因子。该检测基于蛋白和 DNA 的复合体在非变性聚丙烯酰氨凝胶中的迁移速率大大低于 DNA 片段或双链寡核苷酸的迁移速率。凝胶迁移实验首先是将纯化蛋白或蛋白混合物 ( 如核或细胞提取物) 与末端标记的可能含有蛋白结合位点的 DNA 片段共同孵育。然后用非变性聚丙烯酰氨凝胶分析反应产物。使用未标记的 DNA 片段或含有目的蛋白结合位点的寡核苷酸或其它无关的 DNA 序列进行竞争性实验，来确定 DNA 结合蛋白假定结合位点的特异性。