S1 Nuclease (S1 核酸酶) 以内切酶方式降解单链DNA 及 RNA,产生以5'- 磷酸为末端的产物。双链核酸 (DNA:DNA、 DNA:RNA 或 RNA:RNA) 不能被降解,除非使用极高浓度的酶。该酶可以用于去除双链DNA 的单链末端、单链DNA的选择性切除和 RNA 转录图谱。